在福州总督府，王华又对杨凌宣读了正德的旨意:福建布政使之位不能久悬，朝廷已重新任命布政使人选。不日到任。鉴於沿海战事已经平息，倭寇余孽所余无几，剿匪之责交由各地都指挥使负责，免去杨凌战时六省剿倭总督之职，继续代天巡狩，巡察各府道。

至於杨凌的两件奏陈，几乎可以说是全部驳回:现在分散各省的千人队不允许永久留在当地，不过因为剿倭战事并未完全平息，可以暂时留在当地，待残余倭寇全部清剿后再返回原驻地，论功行赏。关於筹建水师讲武堂事，容后再议。

此外就是宣布朝廷对於和葡萄牙建立商贸合作的态度，以及葡萄牙使团重返大明时，指定当地布政使司负责接待，并迎送进京事宜。这些事就和杨凌没有关系了，由布政使参政跪听了，然后转达新任布政使便是。

杨凌东南一行，剿倭平盗战功无数，尤其是在琉球、满刺加驻军。犹如探向大海地一对钳爪，怀抱中的东海南海诸岛也大部重归大明版图，就连夷州也快成了囊中之物。这样的功绩却没有受到任何褒奖和提升。

唯一表示皇帝体贴和信任的是，