黄福与平江伯陈瑄一同管理漕运，并商议令各地漕粮运抵淮安与瓜州，兑与卫所转运，河南于大名府小滩兑与遮洋总海运，山东则于济宁兑与军运，军运费用由百姓承当，以免除其因漕运而耽误农忙，朱瞻基听后批准该策。明朝漕运改为兑运，自此为始。黄福陈言进行兵屯的重要性，以解决饥荒，朱瞻基批准，并命吏部郎中赵新等人负责管理屯田，而由黄福任总裁，此后改为行在户部尚书。

朱瞻基在宫中浏览黄福呈上的漕事便宜疏，并向阁臣杨士奇出示，问道“黄福的言语智虑深远，六卿中有谁可以媲比的”杨士奇答“黄福受知于太祖朱棣，正直明果，一心为国家。永乐初年，在任北京行部，其抚恤民苦；在交趾从官时，总裁藩宪。其所有成就，的确是六卿都无法比及的。黄福现在已经七十岁了，现在后进的年轻人都在公堂里做事，而黄福是四朝重臣，却仍然朝夕奔走而劳苦，这的确不是国家优老敬贤之道啊。”朱瞻基听后称“如果不是您说朕还真不知。”杨士奇又称“南京为国家根本重地，先帝以储宫监国。黄福老成忠直，无论缓急均可倚仗。”朱瞻基表示同意，次日命黄福任南京户部尚书。

黄福兼掌南京兵部事，一次兵部侍郎徐琦出使安南回国，到南京看望黄福，同去的还有陪同徐琦到中国访问的安南使节，当别人指黄福问安南使节是否认识此人时，安南使节竟回答:“南交草木，亦知公名，安得不识”由此可见黄福的名字在十余年后仍被安南人民铭刻在心，久难忘怀。

明英宗朱祁镇即位，黄福加官少保，之后参赞南京守备、襄城伯李隆机务。之后南京文臣参机务的惯例，由黄福始，李隆在任上多用黄福建言，二人相处融洽，使得南京政肃民安。黄福去世后，朝廷一直没有给予赠谥，群臣纷纷议论不平，直到成化初年，朝廷才追赠其为太保，谥号“忠宣”。

黄福为人礼仪修整，不妄言笑。历仕六朝，多有建树，为人正直清廉，并宽恕他人，为官不为赫名而行事细无不谨。此外，黄福自奉节约，家人仅给衣食，所得俸禄，却只用来解决宾客亲戚的穷困，明成祖朱棣曾写出大臣十人的名字，命学士解缙评价，只有黄福得“秉心易直，确乎有守”，对他没有任何贬词。,