明英宗下马盘膝面南坐，不久被也先俘虏，护卫将军樊忠从明英宗旁以所持棰捶死王振，说“我要为天下诛杀这个贼人”突围杀死数十个瓦剌兵，最后也战死。此役，明军死亡过半，骡马二十余万，并衣甲器械辎重尽为也先掠夺。明朝太监喜宁投降，把明朝京城的虚实告诉了也先，也先听说明英宗朱祁镇的车驾到来，非常惊愕不敢相信，见了朱祁镇之后，非常恭敬，让朱祁镇住在他弟弟伯颜帖木儿的大营，也先想要对明英宗行悖逆之事的时候，正好有大雷劈死了也先所乘的马，又看到明英宗的大帐有异样，于是不敢轻举妄动。

土木之变的消息传回京城，明朝举国震动，吏部尚书王直等拥立朱祁钰即位为帝，遥尊朱祁镇为太上皇。也先挟持着朱祁镇继续进攻，由大同、阳和抵达紫荆关，从紫荆关攻入明长城，直逼京师，明朝兵部尚书于谦率领武清伯石亨、都督孙镗等人抵御瓦剌的进犯。也先请明朝大臣出迎明英宗祁镇，没有动静，石亨等人与也先的大军激战，多次打败也先。也先见难以攻破北京就在夜里撤走了，从良乡撤到了紫荆关，大肆劫掠之后出了长城。明朝都督杨洪又在居庸关大败也先的军队，也先仍旧挟持着明英宗北行，也先夜里看到明英宗的大帐之上有异样，大老远看见红光像龙蟠一样，非常的惊异。也先想要把他的妹妹进献给明英宗，却被明英宗推辞了，于是对明英宗更加敬佩，时常杀羊、马，并为明英宗祝酒，对明英宗稽首行君臣之礼。

景泰初年，也先再次挟持明英宗到达大同，郭登拒不接纳，但是仍然想要夺回明英宗，也先察觉之后退军。此时，明朝已经诛杀了向也先报信的喜宁，而且脱脱不花、阿剌知院又遣使与明朝求和，把他们的兵马全都撤回了，也先也想罢兵。同年秋，景泰帝派遣侍郎李实、少卿罗绮、指挥马政等带着诏书前去见脱脱不花和也先，而脱脱不花、也先所派遣的使臣皮儿马黑麻等人已经到了明朝，于是景泰帝又派遣都御史杨善、侍郎赵荣等人率指挥、千户等前去迎接。也先将实情说出，两国应该速速罢兵，明朝应派遣大臣前来迎接朱祁镇。

明朝使臣也说明了迎接明英宗的来意，也先说“太上皇回去之后，仍然能做天子吗”杨善说“大位已定，不会再更改了。”也先带着杨善去见明英宗，并设宴为明英宗送行，明英宗临行前，他们还献上器用、饮食等物，明英宗将要出行，也先与部众都送出了半天的路程，也先、伯颜帖木儿下马跪在地上痛哭说“太上皇如今要走了，我们何时再能见到您”哭了很久才离开，仍然派遣使臣七十人护送到京城。朱祁镇回到京城之后，瓦剌每年都来上贡，朱祁镇对他们也有赏赐，朱祁钰想要和瓦剌断交，不再派遣使臣前去，也先坚决请求互通使臣，尚书王直、金濂、胡濙等相继进言景泰帝，说断绝来往会导致瓦剌前来寻衅。

回到瓦剌之后，也先与脱脱不花向不相睦，脱脱不花名义上虽然是汗，但实际权力却操在也先手里。也先自恃势强，垂涎汗位，脱脱不花的妻子是也先的姐姐，也先想要立自己姐姐的儿子为太子，但是脱脱不花拒绝了，双方发生激烈战争。也先也怀疑脱脱不花和明朝相通，想要谋杀自己，所以进攻脱脱不花。脱脱不花战败逃走，也先派兵追杀他，捉拿了脱脱不花的妻子和孩子，把他的仆人和牲畜分发给诸部属，而且乘胜迫胁周围的各个部落，东到建州、兀良哈，西到赤斤蒙古、哈密，都成了瓦剌的藩属，瓦剌的势力由此达到最盛。

脱脱不花初与弟阿噶多尔济联兵，彼此实力大致相当，难分胜负，后因兄弟内讧，阿噶多尔济叛投也先。脱脱不花势孤被败，遁入兀良哈。脱脱不花死后，也先称“天圣大可汗”，建号“添元”，以次子阿失帖木儿为太师，但也引起一些不满和反抗。阿剌知院攻打也先，也先被暗杀身亡，鞑靼部的孛来又杀了阿剌知院，夺去了也先的母亲和妻子，以及他的玉玺。也先去世后瓦剌逐渐衰微，后分为其长子博罗纳哈勒统领的杜尔伯特部，和次子阿失帖木儿统领的准噶尔部两部分。,