吴氏被废黜以后，宪宗被迫改册王氏为皇后，三十七岁的万氏生下皇长子，从宫女被册为贵妃，得以专宠，而万贵妃所生长子不久就夭折了，再也无法生育。为保住自己的地位，此后所有怀孕的妃子或宫女都被万贵妃逼迫堕胎。柏贤妃偷偷生下的皇次子朱祐极，立为皇太子，次年正月就暴死，众人皆认为是被万贵妃毒杀的。

宫女纪氏在冷宫安乐堂偷偷生下皇三子朱祐樘，纪氏害怕皇子被害，在太监张敏的帮助下，瞒过万贵妃的耳目偷偷哺养，吴废后的居所离安乐堂很近，知道这件事后也往来帮忙，躲在冷宫的夹墙中偷偷养育。这个孩子在太监首领怀恩等人的隐瞒下活了下来，就是日后的孝宗，而宪宗和万贵妃一直不知道。

宪宗始知自己有了儿子，大喜之下将朱祐樘立为皇太子，纪氏也被放出冷宫册为淑妃，但数日后被万贵妃害死，张敏也在恐惧中吞金自杀，吴废后养育皇子之事则被隐瞒下来，所以吴氏没有再遭到万贵妃进一步的迫害，得以在冷宫默默度日。

宪宗去世，皇太子朱祐樘继位，史称孝宗，他念及吴氏当年的恩情，把被遗弃二十多年的吴氏从冷宫放了出来，当作母亲来奉养，下令吴氏的穿着和膳食，都按照太后的制度供应，但没有正式给她平反，也没有给予正式的名分。她的哥哥吴瑛从“羽林卫指挥使”升任“都指挥佥事”，入锦衣卫百户，吴氏风雨一生，晚年才算因为当年的善举得到了一点善报。

吴氏去世，太监刘瑾要按普通宫女的制度，把她的遗体焚烧、草草安埋，大学士王鏊认为不可，武宗也觉得吴氏对父亲孝宗有保全抚育之恩，但是被祖父宪宗废除，不能合葬在茂陵，就同意按照大学士李东阳、王鏊的建议，用英宗惠妃王氏的葬礼规格，安葬在北京金山，但没有谥号。

吴皇后其实是一个心地善良的人，因为看不过宫女万氏的嚣张，逞一时之快，不顾后果廷杖万氏，虽然出了气，但是付出了一生命运转换的代价，最后要不是王鏊据理力争，吴皇后可能真的要在熊熊烈火中化为灰烬了。,