两大头牌坐镇，秒杀肿瘤免疫分析！

今天小编将介绍两个对肿瘤免疫研究大有裨益的工具网站——EPIC&CIBERSORT。说实话，这两个网站一直是小编的科研镇宅之宝，从不轻易拿出来示人，但如今为了给祖(da)国(jia)的科研加油助力，也就忍痛割爱了！

EPIC

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EPIC可根据表达数据分析出8种免疫细胞的浸润比例，分别是:B细胞、肿瘤相关成窍维细胞(CAFs)、CD4+T细胞、CD8+T细胞、内皮细胞、巨噬细胞和NK细胞。

其中，CAFs是肿瘤微环境的重要组成部分，有抑制免疫细胞的功能。可通过分泌生长因子如血管内皮生长因子、血小板衍生因子或其他趋化因子促进肿瘤生长和转移。

重要的是，这个工具的使用方法相当简单粗暴，只需要3步:

1.提交RNA-Seq表达数据;

2.设置参数

2.1选择参考配置文件:血液细胞或肿瘤浸润细胞

2.2选择结果类型:细胞比例()或mRNA比例()

3.每次运行添加个任务名字(Job)，点击RunEPIC。

Run结束后，网站提供结果的table和figures展示，也提供结果的下载。在table里，同时提供检索框，可直接查询感兴趣的检索结果。

研究者可以直接在运行结果后分析各种细胞组分在样本中的差异，当B细胞、CD8+T细胞、NK细胞比例显着下降时，表明组织中的免疫反应被抑制了，免疫细胞的招募过程受到阻碍，肿瘤免疫受到抑制;相反，CAF的增高则与肿瘤的发生发展密切相关。