在古埃及新王国时期衰落之后，埃及人从努比亚撤了回来。在公元前1100年前后，当地的努比亚统治者得以重新确立他们自己的文化并重新宣布独立。他们在第四瀑布附近的纳帕塔建立了一个新的宗教和政治中心，并将帕纳塔定为首都，库施王国就这样建立了。王国区域涵盖第三瀑布以南，越过尼罗河洪泛平原区，勉强属于热带草原气候。库施的农业经济基础是在远离尼罗河的地区种植高粱、稷和养牛。

事实上，库施的统治者在文化上仍然是埃及化的，处处以埃及为榜样，他们与埃及之间的贸易不断，国王们也渐渐积累了财富和权力。公元前730年还进犯埃及并在底比斯获得了对埃及的控制权。他们在埃及统治了60余年，这段时期被称为第二十五王朝或埃塞俄比亚王朝时期。但这短短的60年，这些库施国王们彻底埃及化了，他们戴着上下埃及的双重王冠，崇拜埃及人的神灵，并在埃及殿庙中刻下自己的名字。

公元前670年，亚述人进犯下埃及，库施王廷又撤回了努比亚，从此再也没有回到过埃及。埃及在第二十六王朝时期的回光返照期间，曾一度于公元前593年派军队入侵到第四瀑布地区，并洗劫了纳帕塔。有鉴于埃及人的威胁，库施人不得不将行政中心转移到了南部小镇麦罗埃。

麦罗埃位于第五瀑布和第六瀑布之间的尼罗河左岸（东面），位于尼罗河和阿特拉巴河之间的平原地区被称为麦罗埃岛，这里夏季降雨非常丰沛，相对于纳帕塔地区，农业要发达的多，人们可以在这里种植热带谷物作物高粱和稷，而且可以通过灌溉扩大耕地面积。

在尼罗河下游的埃及洪泛平原上，土地的清理和翻耕不是问题，因此，人们不必非要用到铁制用具。但是，在第二瀑布上方，努比亚地界的尼罗河流段较为狭窄，因此可耕作的洪泛平原面积也就较小。人们意识到，纳帕塔没有充足的农业用地来供应给大量的农业人口。而麦罗埃岛属于热带夏季降雨地区，人们可以在这里种植热带谷类作物高粱和稷，人们在发展耕地的同时还放养牛羊等家畜。同时，麦罗埃人借助铁制工具，成功发展出一种类似于后世澳大利亚的混合型农业。